Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB3P54284 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNB3P54284 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB3P54284 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB3P54284 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms