Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBX2P52951 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBX2P52951 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBX2P52951 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX2P52951 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBX2P52951 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBX2P52951 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GBX2P52951 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX2P52951 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX2P52951 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX2P52951 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX2P52951 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX2P52951 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX2P52951 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX2P52951 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms