Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD8P48556 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD8P48556 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMD8P48556 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMD8P48556 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms