Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC4P43686 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC4P43686 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC4P43686 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC4P43686 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC4P43686 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSMC4P43686 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC4P43686 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC4P43686 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC4P43686 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC4P43686 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC4P43686 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PSMC4P43686 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC4P43686 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC4P43686 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC4P43686 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC4P43686 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC4P43686 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC4P43686 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PSMC4P43686 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMC4P43686 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms