Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSOP43234 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSOP43234 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSOP43234 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSOP43234 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSOP43234 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSOP43234 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSOP43234 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSOP43234 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSOP43234 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSOP43234 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSOP43234 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSOP43234 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSOP43234 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSOP43234 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSOP43234 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSOP43234 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSOP43234 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSOP43234 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSOP43234 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSOP43234 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSOP43234 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSOP43234 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSOP43234 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSOP43234 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSOP43234 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSOP43234 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSOP43234 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSOP43234 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSOP43234 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms