Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK1P39086 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK1P39086 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK1P39086 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms