Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP6P35125 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP6P35125 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP6P35125 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP6P35125 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP6P35125 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP6P35125 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP6P35125 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP6P35125 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP6P35125 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP6P35125 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP6P35125 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP6P35125 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
USP6P35125 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP6P35125 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP6P35125 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP6P35125 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP6P35125 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP6P35125 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP6P35125 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP6P35125 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP6P35125 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP6P35125 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP6P35125 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP6P35125 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP6P35125 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP6P35125 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP6P35125 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP6P35125 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP6P35125 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP6P35125 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP6P35125 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP6P35125 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP6P35125 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP6P35125 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP6P35125 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP6P35125 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP6P35125 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP6P35125 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP6P35125 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP6P35125 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
USP6P35125 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP6P35125 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP6P35125 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP6P35125 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
USP6P35125 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
USP6P35125 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP6P35125 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USP6P35125 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP6P35125 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USP6P35125 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP6P35125 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP6P35125 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USP6P35125 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USP6P35125 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
USP6P35125 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP6P35125 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP6P35125 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
USP6P35125 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP6P35125 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP6P35125 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP6P35125 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms