Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASQ1P31415 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASQ1P31415 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 395.1 ms