Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA7P31268 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXA7P31268 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms