Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB4P28070 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMB4P28070 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB4P28070 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms