Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK1P06493 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK1P06493 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK1P06493 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK1P06493 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK1P06493 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK1P06493 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK1P06493 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK1P06493 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK1P06493 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK1P06493 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK1P06493 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK1P06493 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK1P06493 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK1P06493 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK1P06493 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK1P06493 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK1P06493 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK1P06493 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK1P06493 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK1P06493 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK1P06493 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK1P06493 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK1P06493 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK1P06493 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK1P06493 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK1P06493 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK1P06493 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK1P06493 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK1P06493 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms