Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1RP00736 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1RP00736 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1RP00736 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1RP00736 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C1RP00736 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C1RP00736 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1RP00736 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1RP00736 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1RP00736 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1RP00736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1RP00736 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1RP00736 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1RP00736 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1RP00736 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1RP00736 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C1RP00736 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1RP00736 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1RP00736 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1RP00736 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C1RP00736 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1RP00736 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1RP00736 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1RP00736 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1RP00736 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1RP00736 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1RP00736 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1RP00736 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1RP00736 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms