Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN12O95859 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN12O95859 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN12O95859 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms