Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRCPO75575 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRCPO75575 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRCPO75575 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRCPO75575 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRCPO75575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRCPO75575 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRCPO75575 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRCPO75575 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRCPO75575 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRCPO75575 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRCPO75575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CRCPO75575 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRCPO75575 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRCPO75575 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRCPO75575 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRCPO75575 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRCPO75575 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRCPO75575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRCPO75575 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRCPO75575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRCPO75575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRCPO75575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRCPO75575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRCPO75575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRCPO75575 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRCPO75575 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRCPO75575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRCPO75575 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRCPO75575 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRCPO75575 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRCPO75575 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRCPO75575 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRCPO75575 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms