Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A1O14983 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A1O14983 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A1O14983 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A1O14983 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A1O14983 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2A1O14983 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A1O14983 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A1O14983 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2A1O14983 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2A1O14983 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2A1O14983 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms