Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK3O14649 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNK3O14649 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms