Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN6O00399 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN6O00399 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN6O00399 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN6O00399 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN6O00399 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCTN6O00399 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN6O00399 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN6O00399 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN6O00399 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN6O00399 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN6O00399 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms