Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARNTLO00327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARNTLO00327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARNTLO00327 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARNTLO00327 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms