Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2CD4DB7Z1M9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C2CD4DB7Z1M9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2CD4DB7Z1M9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms