Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC22A31A6NKX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC22A31A6NKX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC22A31A6NKX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms