Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR47

SPTY2D1-AS1, SPTY2D1 antisense RNA 1, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms