Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.71■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.65■■■■■ 4.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms