Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y9

LY96, Lymphocyte antigen 96, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY96Q9Y6Y9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LY96Q9Y6Y9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LY96Q9Y6Y9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LY96Q9Y6Y9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY96Q9Y6Y9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms