Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAXBP1Q9Y5B6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAXBP1Q9Y5B6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAXBP1Q9Y5B6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms