Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LRP12Q9Y561 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRP12Q9Y561 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRP12Q9Y561 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms