Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP11BQ9Y2G3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP11BQ9Y2G3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP11BQ9Y2G3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms