Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A9

B3GNT3, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT3Q9Y2A9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT3Q9Y2A9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3GNT3Q9Y2A9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
B3GNT3Q9Y2A9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms