Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NOD1Q9Y239 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOD1Q9Y239 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOD1Q9Y239 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms