Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HCN2Q9UL51 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN2Q9UL51 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN2Q9UL51 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 710.6 ms