Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCH4Q9P2E8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH4Q9P2E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms