Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms