Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPG21Q9NZD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPG21Q9NZD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPG21Q9NZD8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPG21Q9NZD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms