Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA8Q9NY65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA8Q9NY65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA8Q9NY65 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA8Q9NY65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA8Q9NY65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms