Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD8Q9NX08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD8Q9NX08 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD8Q9NX08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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