Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCND1Q9NSA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms