Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX15Q9NRS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX15Q9NRS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX15Q9NRS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX15Q9NRS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms