Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMC2Q9NRP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMC2Q9NRP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMC2Q9NRP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms