Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMYD2Q9NRG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD2Q9NRG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMYD2Q9NRG4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMYD2Q9NRG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms