Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHST12Q9NRB3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHST12Q9NRB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms