Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPHNQ9NQX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPHNQ9NQX3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPHNQ9NQX3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPHNQ9NQX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms