Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS3Q9H6R3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSS3Q9H6R3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSS3Q9H6R3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms