Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TAF1DQ9H5J8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1DQ9H5J8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1DQ9H5J8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms