Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC3Q9BY71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC3Q9BY71 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC3Q9BY71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC3Q9BY71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms