Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDA1Q9BW61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDA1Q9BW61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms