Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms