Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00467Q9BRT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00467Q9BRT7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00467Q9BRT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms