Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL1Q99961 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL1Q99961 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms