Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1MQ96MI6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1MQ96MI6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1MQ96MI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms