Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAPNS2Q96L46 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAPNS2Q96L46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPNS2Q96L46 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPNS2Q96L46 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms