Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
JPH4Q96JJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
JPH4Q96JJ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
JPH4Q96JJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
JPH4Q96JJ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms